Тайната служба IMF е закрита, тъй като е въвлечена в международен заговор за терористична бомбена атака над Кремъл. Президентът на САЩ обявява началото на режим „Фантом”. Ако приеме мисията, Итън Хънт и неговият нов екип ще трябва да премине под дълбоко прикритие, за да изчисти името на организацията. Не могат да очакват помощ, не могат да осъществяват контакт с никого и трябва да излязат напълно от шпионската мрежа. Ако някой от тях бъде заловен, ще бъде обявен за терорист.