Призован у дома на Земята, екипажът на „Ентърпрайз” и неговият капитан Кърк (Крис Пайн) се натъкват на ужасяваща сила в тяхната собствена организация.Целият флот е взривен, а всичко и всички, за които са се борили досега, вече са напуснали техния свят. Със съвсем личен мотив за разплата, капитан Кърк повежда хайка до обявен за военна зона свят, в който да  залови един човек, превърнал се в оръжие за масово унищожение.