Микеланджело, Донатело, Леонардо и Рафаело се завръщат на голям екран, за да се преборят с още по-големи и по-лоши злодеи. На тяхна помощ ще се притекат Ейприл О'Нийл (Меган Фокс), Върн Фенуик (Уил Арнет) и новобранецът с хокейна маска Кейси Джоунс (Стивън Амел). След като суперзлодеят Шрьодер бяга от затвора, той се съюзява с лудия учен Бакстер Стокам (Тайлър Пери) и двамата му глуповати привърженици Бибоп (Гари Антъни Уилямс) и Рокстеди (звездата от WWE Стивън Фарели), за да изпълнят своя дяволски план да превземат света. Костенурките се подготвят да обезвредят Шрьодер и новия му екип, но се оказват лице в лице с по-голямо зло: всеизвестния Кранг.